首 页   本刊简介  编委会  审稿专家  在线期刊  写作规范  广告合作  联系我们
您现在的位置:首页 => > 研究进展 > 表现为低 GGT 进行性肝内胆汁淤积症的ABCB11杂合子检出的罕见/新发同..
表现为低 GGT 进行性肝内胆汁淤积症的ABCB11杂合子检出的罕见/新发同义变异或内含子变异的剪接分析
文章发布日期:2018-06-28   来源:本站原创  作者:  点击次数:150次

 
调整字体大小:


背景和目的进行性家族性肝内胆汁淤积症2 型(PFIC2)是常染色隐性遗传性疾病。部分表现为低GGT进行肝内胆汁淤积症的患儿在ABCB11检出1个致病突变1个罕见/新发同义变异或内含子变异。本研究旨在分析这些罕见/新发同义变异或内含子变异对剪接的影响。

方法:本研究纳入200910月至20166月间,表现为低 GGT 的进行性肝内胆汁淤积症患儿中检出的罕见/新发同义变异或内含子变异。通过在线软件功能预测和minigene剪接试验,分析变异对剪接的影响。

结果共纳入5ABCB11杂合子患儿,均表现为低GGT进行性肝内胆汁淤积症。检出5个致病性未明的罕见/新发变异;含3 个内含子变异(c.908+5G>Ac.2815-8A>G c.612-15_-6del2个同义变异(c.1809G>A, p.K603K c.2418C>T, p.G806G)。4例患儿完善了家系研究,证实为复合杂合。5变异在人群中的频率低于0.1%,甚至为新发突变,经在线软件预测均可能对剪接存在影响。Minigene剪接试验亦证实5罕见/新发变异对剪接影响c.908+5A 导致野生型5’剪接位点(splice site, ss)无法识别,位于其上游的潜在剪接位点被激活,引起至少约78.5%异常剪接。c.2815-8G 在野生型 3’ ss上游形成新 的剪接位点,引起全部转录产物剪接异常c.612-15_-6del 引起约 24.8%的转录产物跳跃Exon 8;或激活潜在剪接位点,导致其余转录产物Exon 8靠近3’ ss55个碱基被异常剪接。 c.1809A的所有转录产物跳跃Exon15c.2418T 激活Itron 20野生3’ ss下游的潜在剪接位点,导致Exon20 Exon21靠近 3’ ss62个碱基被异常剪接

结论:本研究成功检出了5个具有致病性的同义变异或内含子变异。某些共同特征有助于选择合适的变异进行剪接研究。


复旦大学附属儿科医院分子诊断中心 王建设 报道
 
地址:长春市东民主大街519号《临床肝胆病杂志》编辑部 邮编:130061 电话:0431-88782542/3542
临床肝胆病杂志 版权所有 Copyright © 2009 - 2013 Lcgdbzz.org. All Rights Reserv 吉ICP备10000617号

吉公网安备 22010402000041号