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乙型肝炎病毒单倍型多样性分析检测到跨基因型和慢性病阶段的显著保守序列

作者: 徐洪芹 发布日期: 2021-06-23 阅读次数:
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在对来自四种主要基因型 (ABCD) 的慢性乙型肝炎感染的多个阶段的 368 名患者进行深度测序后,我们对完整的乙型肝炎病毒 (HBV) 基因组进行了单倍型分析,分析了 4,110 种单倍型以识别与疗效相关的病毒变异和 疾病进展。

18.2% -41.8% 的核苷酸序列和 5.9%-34.3% 的氨基酸序列在所有检查的基因型和阶段中都是 100% 保守的,具体占比取决于所分析的区域。 到第 192 周时乙型肝炎 e 抗原 (HBeAg) 丢失与基线时的不同单倍型群体相关。 单倍型群体在 HBV 基因组和慢性乙型肝炎病史中有所不同,这在前核心/核心基因中最为明显。 与“免疫耐受”、HBeAg 阳性1期的受试者相比,免疫活性、HBeAg 阳性慢性肝炎 2 期 (11.8) 和 HBeAg 阴性慢性肝炎 4 期 (16.2) 中每位患者的平均单倍型数(频率)更高 (4.3,P < 0.000 1)。与其他基因型(A = 11.8,C = 11.8,D = 13.6)相比,基因型 B 的单倍型出现率最低(6.2,P < 0.000 1)。 在慢性乙型肝炎病史过程中(除基因型 C 外的所有基因型),单倍型遗传多样性在第 1 阶段最低,在第 2 阶段增加,在第 4 阶段最高。替诺福韦治疗第 192 周的 HBeAg 消失与基线时的不同单倍型相关。

尽管在慢性乙型肝炎自然史的各个阶段存在一定程度的 HBV 单倍型多样性和异质性,但在多个 HBV 基因型中鉴定了关键基因和调控区域的高度保守序列,应进一步研究这些基因型作为抗病毒治疗的靶点和治疗反应的预测因子。



摘译自WAGNER J, YUEN L, LITTLEJOHN M, et al. Analysis of hepatitis B virus haplotype diversity detects striking sequence conservation across genotypes and chronic disease phase[J]. Hepatology, 2021, 73(5): 1652-1670. DOI: 10.1002/hep.31516.

 (吉林大学第一医院感染病中心肝病科 徐洪芹 报道)


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作者: 徐洪芹 发布日期: 2021-06-23 阅读次数: