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慢乙肝病毒携带者1p36.22为肝细胞癌易感基因区域

作者:  发布日期: 2010-08-29 阅读次数:
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   2010年8月2日,军事医学科学院公布了中国学者在肝癌研究领域取得的重大发现,该院研究人员率先采用全基因组关联分析(GWAS)在慢性乙型肝炎病毒携带者体内发现了一个新的肝癌易感基因区域。 《自然·遗传学》(Nature Genetics)杂志也同时在线发表了这一具有世界领先水平的原创性研究成果。

  个体间肝癌发生的差异可能与人体的易感基因密切相关。肝癌易感基因的鉴定,不但有助于深入解析肝癌的发病机制,而且能为肝癌的风险预测、早期预防以及新药的筛选提供理论依据和生物靶标。

  近年来,GWAS技术已被广泛应用于定位复杂疾病的易感基因。然而,迄今为止,仍未见肝癌相关GWAS报告。为全面确定肝癌的遗传易感基因,周钢桥研究员带领的课题组联合中国10多家医院和研究所,首先在招募自肝癌高发区广西扶绥的715例乙型肝炎病毒携带者(包含肝癌病例355例,对照360例)中,分型了440794个单核苷酸多态性(SNP)位点。

  经过质量控制后,研究者对最显著关联的前45个SNP在另外4个病例对照人群(分别招募自广东、上海、江苏和北京,总的肝癌病例1962例,对照1430例)和1个核心家系(招募自广西,共159例)中进行了重复验证。

  结果发现,1p36.22区域的1个SNP位点rs17401966在上述5个研究人群中均得到验证。在合并所有6个研究人群之后,rs17401966达到全基因组水平的显著关联程度,联合P值达1.7 × 10-18[联合优势比(OR)=0.61]。

  进一步的连锁不平衡(LD)作图分析显示,该区域包含了UBE4B、KIF1B和PGD三个基因。免疫组化试验显示,UBE4B的表达没有异常,但KIF1B和PGD在肝癌组织的表达显著减少。同时,实时定量聚合酶链反应(PCR)试验显示,KIF1B的表达与关联SNP的基因型具有相关性,其低表达与肝癌高风险基因型显著相关。

  由此,我们确定1p36.22的UBE4B-KIF1B-PGD区域是一个新的肝癌易感基因区域,这为1p36.22区域影响肝癌的发生风险提供了强有力的证据,并提示KIF1B、UBE4B或PGD相关通路参与了肝癌的发病机制。

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作者:  发布日期: 2010-08-29 阅读次数: