为了识别HCV诱导HCC的遗传易感因素,研究者们使用日本721例HCV诱发HCC病例和2890例HCV阴性对照的432703个常染色体SNP,进行全基因组相关性研究(GWAS)。由于从慢性丙型肝炎(CHC)到HCC的进展受年龄、性别因素的强影响,研究者在分析中将年龄和性别作为所有检测位点的共变量进行logistic回归分析。对于在GWAS中显示可能有关联(P<1×10-5)的单核苷酸多态性(SNP),进一步在673个病例和2596名对照者中进行基因型分析。
通过GWAS,共识别出8个独立的显示可能有关联的位点。复制后,发现MK基因的5’端侧翼区中有一个新位点(SNP)(P联合=4.21x10-13,OR=1.39)与HCV诱发的HCC强相关,而其余7个SNP不能复制此关联性。在CHC患者中进行的后续分析提示,该SNP与CHC易感性不相关(P=0.61),但与CHC向HCC的进展显著相关(P=3.13x10-8)。研究者还发现,SNP的危险等位基因与HCV诱发HCC患者中血清MK水平较低相关(P=1.38x10-13)。










